Genetic Analyses with ASReml-R

• Prof. Saulo Fabrício da Silva Chaves
• saulochaves@usp.br
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• Departamento de Genética - ESALQ/USP

O Laboratório de Genômica, Análise e Melhoramento de Plantas apresenta o curso Genetic Analyses with ASReml-R, este curso de dois dias se concentrará nos fundamentos do uso do ASReml-R, versão 4.2, para a análise de dados genéticos  provenientes, principalmente, de programas de melhoramento agrícola, animal, aquícola e florestal.

O curso enfatizará as culturas agrícolas. O ASReml-R é um software estatístico (e biblioteca em R) que ajusta modelos lineares mistos usando a metodologia REML e calcula valores BLUP. Os conceitos genéticos necessários para a construção de modelos lineares apropriados serão abordados, juntamente com a compreensão da interface do ASReml-R, entrada e manipulação de dados, construção/especificação adequada de modelos lineares (e sua estrutura de variância) e suas aplicações em estratégias de melhoramento. Além disso, serão discutidas algumas extensões sobre o uso de delineamentos estatísticos complexos e sobre a interpretação genética/biológica dos resultados.

Este curso é fortemente orientado para o aspecto prático da análise de conjuntos de dados reais e complexos. Recomenda-se ter algum conhecimento prévio mínimo da metodologia de modelos lineares mistos, teoria genética e familiaridade com R (www.r-project.org). A apresentação incluirá exemplos de estudos com ensaios univariados, multivariados e multiambientais, juntamente com algumas análises espaciais. O curso também incluirá uma introdução à seleção genômica e ao uso do ASReml-R para realizar análises de GBLUP.

Dia 1 – 23/06
Tópico 1: Introdução ao ASReml-R
Tópico 2: Teoria de Modelos Lineares Mistos
Tópico 3: Teoria de Genética e Análise de dados genéticos com o ASReml-R
Tópico 4: Modelos Parentais
Tópico 5: Incorporação de Matrizes de Parentesco
Tópico 6: Modelo Animal
Tópico 7: Estruturas de Covariância no ASReml-R

Dia 2 – 24/06
Tópico 8: Modelos Bivariados/Multivariados
Tópico 9: Análises Espaciais
Tópico 10: Análises de dados oriundos de múltiplos ambientes
Tópico 11: Introdução à Seleção Genômica
Tópico 12: Preparando matrizes de parentesco genômicas para o GBLUP
Tópico 13: GBLUP com o ASReml-R
Tópico 14: Seleção Genômica como uma estratégia de melhoramento

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Valor único
R$ 100,00

Requisitos
Serão realizadas aulas formais, sessões práticas baseadas em ASReml-R, que utilizam dados reais. Os participantes devem trazer seu próprio laptop com o R-Studio e a biblioteca ASReml-R pré-instalados. Forneceremos uma licença completa do ASReml-R 4 por 30 dias. Ele pode ser instalado em PCs (com sistema operacional Windows) e Mac.

Uma semana antes do workshop, você receberá instruções para instalar o software. É sua responsabilidade garantir que seu computador esteja funcionando corretamente com o ASReml-R, mas alguma ajuda (limitada) será fornecida logo antes do início do workshop.