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Workshop de Montagem de Genomas
Transmissão ao vivo
Capacitar pesquisadores, estudantes e profissionais da área de biologia, genética e bioinformática a compreender e aplicar as principais etapas envolvidas na montagem e anotação de genomas.
Pagamento
Pagamento
À vista no pix, boleto bancário* ou cartão de crédito
Parcelamento no cartão de crédito.
*A forma de pagamento por boletos é bloqueada 4 dias antes do evento devido ao prazo de compensação bancária.
*** Cancelamento somente mediante envio de e-mail para cancelamento@fealq.com.br. Solicitações em até 7 (sete) dias após a contratação serão reembolsados integralmente, conforme previsto em legislação.
A Fealq se reserva o direito de adiar, cancelar ou alterar a oferta de curso/evento. Em caso de cancelamento por parte da Fealq, o valor pago pelo participante será integralmente devolvido.
- Jose Baldin Pinheiro
- jbaldin@usp.br
- Departamento Genética - Esalq/USP (GVENCK)
Dia 1 – Genomas e tecnologias de sequenciamento
• Importância do estudo dos genomas
• Introdução à tecnologia de sequenciamento (illumina, pacbio, nanopore)
• Perfil genômico e controle de qualidade baseados em K-mer
• Demonstração de conjuntos de dados
Dia 2 – Ferramentas para a montagem de genomas
• Hifiasm
• Hi-C/Omni-C e Yahs
• Métricas de completação (BUSCO, compleasm)
Dia 3 – Atividades práticas de montagem de genomas
• Prática Juicebox
• Compartilhar exemplos de Hi-C data
• Recomendar os próximos passos
Anotação TE
Anotação de genes
Análise de sintenia
Ministrado por: Renan Souza, João Rabelo e Matheus Scaketti
Metodologia
Aula expositiva dialogada com demonstração prática em tempo real. Utilização de exemplos reais e materiais de apoio (slides, scripts e arquivos de exemplo) disponibilizados aos participantes.
Valor único R$ 90,00
Público-Alvo
Estudantes e profissionais das áreas de biologia, biotecnologia, genética, agronomia e bioinformática, especialmente aqueles envolvidos com melhoramento genético, genômica estrutural ou que desejam aplicar pipelines de montagem e anotação de genomas.
Pré-Requisitos e Seleção
Para melhor aproveitamento, recomenda-se que o participante tenha:
● Conhecimentos básicos em biologia molecular e genética;
● Familiaridade com o ambiente Linux/Unix (navegação via terminal, manipulação de arquivos);
● Noções iniciais de bioinformática (por exemplo, FASTA/FASTQ, alinhamentos, bancos de dados genômicos);
● Experiência prévia com análise de dados de sequenciamento.
Certificação
O curso contará com a emissão de certificados de 06 horas emitida por meio da Fealq para aqueles participantes que obtiveram frequência em pelo menos 75% do curso.
Local
Online via Google Meet. É recomendado que os participantes tenham uma conexão de rede boa e estável.
APOIO:
REALIZAÇÃO
